Fosil yakıtların sadece kullanımından doğan zararlar değil, çıkartıldıkları ve işlendikleri bölgelerdeki zararları da çevre kirliliği için büyük bir tehdittir. Araştırmalar çevre için önlem alınmayan pek çok kömür, petrol ve doğalgazın çıkarıldığı alanlarda devasa ve çoğunlukla geri dönüştürülmesi yıllar sürecek hasarlar tespit etmiştir. Dünyadaki her 10 ölümcül enfeksiyonun 9’unda fosil enerjinin yarattığı hava kirliliğinin etkisi bulunmaktadır. Ayrıca asit yağmurlarının etkilerinin artmasına sebep olmaktadırlar. Fosil enerjinin zararlarıyla baş etmenin en hızlı yolu rüzgâr türbini enerjisi, güneş enerjisi ve elektrik enerjisine geçiştir.
